气相色谱仪出部分反峰指大部分峰为正向出峰，但一部分峰为反向出峰，或基线往负方向偏移。具体排除方法如下：
1、使用空气压缩机时，检查确认反向出峰或基线往负方向偏移是否与空气压缩机的动作（空气压力不足时空气压缩机自动动作）在时间上是否同步。
2、较多水份进入离子化检测器时，火焰的燃烧状态短时间会起变化，伴随出现反峰（这不是异常）。
3、检查各种气体的流量设置是否正常，以及是否存在漏气现象。
4、检查载气的纯度，如果载气里面有微量不纯物，而样品的纯度如果比载气的纯度高，就会出反峰。
5、气路切换时有压力冲击，也会出现反峰，此时气路中应加接稳压装置。
6、使用TCD时，如果载气和样品的热导系数过于接近，也会出现一部分或全部的反峰。
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